实验室有机废水处理方法可以借鉴其它有机废水的处理。对于有机物浓度高、毒性强、水质水量不稳定的实验室废水，生物法处理效果不佳，而物化法对此类废水的处理表现出明显的优势。有机废水的处理方法主要有物理化学处理法和生物处理法。物化处理法是应用物理化学作用及其原理将废水中的污染物成分转化为无害物质，使废水得到净化的方法。如光化学混凝法、氧化—吸附法、焚烧法、萃取法、湿式催化氧化法、电化学法和膜分离法等。单独利用物化法处理高浓度有机废水，不仅处理难度大、成本高，并且处理效果也不够好，一般很少单独使用。生物处理法是利用生物降解水中的污染物质作为自身的营养和能源，同时使废水得到净化的方法。
1、臭氧类氧化法
臭氧长期以来就被认为是一种有效的氧化剂和消毒剂，采用认氧化处理有机废水反应速度快、无二次污染。能够氧化单独作用时难以氧化降解的有机物。
2、多相光催化氧化法
该方法能够去除许多难降解或用其他方法难以去除的物质，如氯仿、多氯联苯、有机磷化合物、多环芳烃等也可以利用此方法去除，大多数有机污染物的去除率可达100%。具有能耗低、操作简便、反应条件温和、无二次污染等突出优点。
3、Fenton试剂法
用Fenton试剂法处理有机废水的试验中，pH可不必调节，硫酸亚铁(FeSO4)和双氧水(H2O2)的最佳用量为115g、410mL，反应时间在30min时，可以达到较好的处理效果，COD去除率达到75%以上。在反应中能产生氧化能力很强的羟基自由基，使有机废水中的有机物能很快的降解。该工艺具有设备简单、反应条件温和、操作方便、高效等优点，在处理有毒有害难生物降解有机废水中极有应用潜力，但是该方法处理费用高，只适用于低浓度、少量废水的处理。
4、湿式氧化技术
湿式氧化，又称湿式燃烧，是处理高浓度有机废水的一种行之有效的方法。其基本原理是在高温高压的条件下通入空气，使废水中的有机污染物被氧化，按处理过程有无催化剂可将其分为湿式空气氧化和湿式空气催化氧化两类。湿式空气氧化该方法主要用于处理废水浓度于燃烧处理而言太稀、于生物降解处理而言浓度又太高、或具有较大毒性的废水。湿式空气催化氧化法是在传统的湿式氧化处理工艺中加入适宜的催化剂使氧化反应能在更温和的条件下和更短的时间内完成。
5、活性炭吸附法
活性炭吸附法多用于去除用生物或物理、化学法不能去除的微量呈溶解状态的有机物。实验室浓有机废水含有大量试验残液和废溶剂，其主要成分为烷烃类、芳香族以及能使液面表面自由能降低很多的物质，且废水浓度高、量小、呈酸性，很适合用活性炭吸附处理。处理工艺流程为先经过简单分离把废水中的有机相分离出来，再经过活性炭二级吸附，COD的去除率可达到93%，同时活性炭还吸附部分无机重金属离子。